在Windows上安裝ImageJ，可訪問(wèn)官網(wǎng)下載Windows版本的安裝包，解壓后運(yùn)行即可。無(wú)需復(fù)雜配置，直接雙擊啟動(dòng)程序使用。
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首先你需要在官網(wǎng)下載的安裝
還需要好的環(huán)境。
最好查看一些教程 -
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memory只能設(shè)定為63M，不能按照說(shuō)明書(shū)的要求設(shè)定為128M，也不能導(dǎo)入圖片。
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這在ImageJ里是比較常用的操作，既然兩天了也沒(méi)有人回答，我就嘮叨一下吧。
基本上，沒(méi)有特別要求，怎么照都行，可以疊加。
廣義上，共聚焦圖像的疊加，通常有不同兩種情況：
1，multichannel，雙重或多重?zé)晒鈽?biāo)記，不同通道不同顏色熒光，這種疊加可稱為merge；
2，stack，多層光切片的疊加，一般是Z軸方向，可以有多種算法，這種疊加可稱為project。
當(dāng)然，這兩種情況也可以共同出現(xiàn)（為簡(jiǎn)單見(jiàn)我這里只說(shuō)單純情況），一般這兩種情況的處理方法不同。
我感覺(jué)你是第一種情況。我就按這個(gè)說(shuō)吧：
可以根據(jù)你所使用的共聚焦提供的軟件設(shè)置每個(gè)通道為不同的顏色。其實(shí)，本質(zhì)上來(lái)說(shuō)都是偽彩（pseudocolor），就算你用同一種顏色，之后在ImageJ里也可以隨意改變成你期望的兩種顏色。
我通常用leica的機(jī)器，你可能能用別牌子的機(jī)器，這都沒(méi)有關(guān)系。一般機(jī)器輸出的圖片都可以從中分離或者在confocal自帶的軟件里導(dǎo)出成.tiff格式,這個(gè)格式大多軟件都認(rèn)，也包括ImageJ。
現(xiàn)在我默認(rèn)你已經(jīng)有了兩個(gè)來(lái)自于同一個(gè)樣品的不同熒光通道的tiff圖片，現(xiàn)在你在imageJ里面依次將它們打開(kāi)，現(xiàn)在到ImageJ主界面菜單欄——》Image——》color——》mergechannels選中，會(huì)跳出colormerge對(duì)話框，有幾個(gè)選項(xiàng)我不多講了，按著軟件的默認(rèn)OK就行了。試試吧
另外，如果你是Zeiss的confocal輸出的文件，ImageJ（V1.45）有現(xiàn)成的plugin，操作會(huì)更方便一點(diǎn)。
還有問(wèn)題的話不妨先看看help。
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