考科目三自動擋和手動擋的區別主要有操控方式的不同以及駕照類型的不同。
操作方式不同:手動檔需要駕駛者配合離合器進行換檔操作,自動檔則由變速箱根據設定的傳動比來操作,不需要人工干預。
駕照類型不同:C2駕照考試使用小型自動擋車輛,C1駕照考試使用小型手動擋車輛。

除此之外,自動擋和手動擋的科目三考試內容是幾乎是一模一樣的。
擴展資料:科目三駕考內容(以下考試內容默認為手動擋的具體操作,自動擋操作會在括號內解釋)

1、夜間行駛:
指紋驗證成功后,白天考試學員在起步前,考生聽到語音提示"下面開始模擬夜間燈光使用,請按照語音提示進行操作"后,考生應開始燈光操作。
2、起步
當聽到語音提示"請起步"后,踩離合器(自動擋不需要),將檔位掛入一檔,打左轉向燈并閃爍大于3秒,同時左扭頭觀察左后視鏡,確認安全后,鳴笛,放駐車制動器,平穩起步(若為自動擋則緩慢踩加油踏板),撥正轉向燈。在坡路起步時禁止后溜。
3、路口右轉彎
當聽到語音提示"前方路口右轉彎"后,開右轉向燈并閃爍大于3秒后,按導向箭頭車道右轉至行車道。
4、掉頭
當聽到語音提示"前方請掉頭"后,考員應打左轉向燈并閃爍大于3秒,通過(左)后視鏡觀察左后方交通情況,確認安全后,方可降低車速,換入低檔(自動擋不需要),駛入掉頭區域。駛入掉頭區域時應左右觀察路況,確認安全后駛入新車道正常行駛并關閉左轉向燈。
6.直行通過路口
當聽到語音提示"前方通過路口"后,考生應減速慢行(剎車),觀察道路交通情況,按照信號燈指示行駛,通過路口時,車速應低于30km/h。路口內禁止停車。
7.路口左轉彎
當聽到語音提示"前方路口左轉彎"后,開左轉向燈(大于3秒)后,按導向箭頭車道左轉至行車道。
8.通過公交車站
當聽到語音提示"通過公交車站",考生應減速慢行(剎車)或在進入該區域前車速低于30km/h,左右(扭頭)觀察,注意避讓公交車輛及行人,確認安全后方可通過。
9.加減擋操作(自動擋考生沒有此項考試項目)
當聽到語音提示"請完成加減檔動作"后,考生應該將檔位調整至2檔,從2檔依次升至5檔,在5檔位時時速需超過40km/h,再將檔位依次降至2檔。
10.會車
當聽到語音提示"前方會車"后,考生須注意前方來車,靠行車道右側行駛至會車項目結束。注意避讓其他車輛,不能壓非機動車道線。
11.超車
當聽到語音提示"請完成超車動作"后,考生應打左轉向燈(大于3秒),同時通過(左)后視鏡觀察左后方交通情況,確認安全后方可向左轉動方向盤,駛入左側車道進行超車。超過被超車輛,確認與被超車輛保持安全距離后,打右轉向燈(大于3秒),同時通過(右)后視鏡觀察右后方,確認安全后駛入原車道正常行駛。當不具備超車條件時,可等待條件允許時,完成超車動作,禁止右側超車。
12.直線行駛
當聽到語音提示"請保持直線行駛"后,考生應目視前方,雙手控制好方向盤,保持車輛直線行駛。嚴禁騎壓道路分界線。
13.變更車道
當聽到語音提示"請變更車道"后,考生應打(左)轉向燈(大于3秒),同時(左扭頭)通過(左)后視鏡觀察后方交通情況,確認安全后,向(左)轉動方向盤變更車道。當不具備變更條件時,考生應減速慢行,等待條件允許后進行變更車道。嚴禁連續變更兩條車道。
14.通過人行橫道
當聽到語音提示"前方通過人行橫道"后,考生應減速慢行(剎車)或在進入該區域前車速低于30km/h。若有行人通過,請把車輛停在安全線外等候,在行人通過人行橫道后方可通過。
15.通過學校區域
當聽到語音提示"前方通過學校"后,考生應減速慢行(剎車),或在進入該區域前車速低于30km/h,左右(扭頭)觀察,注意避讓學生,確認安全后方可通過。
16.靠邊停車
當聽到語音提示"請靠邊停車"后,考生打右轉向燈(大于3秒),同時通過(右)后視鏡觀察右后方交通情況,確認安全后,將車輛(右側)平行停放在小于路沿石(或者道路邊緣實線)30厘米以內處,但不能壓到路沿石(或者道路邊緣實線),停穩車輛,拉起駐車制動器,摘空檔。
聽到語音提示"考試合格,請下車"或"考試未通過,請下車"后,觀察左后方交通情況,確認安全后,打開車門下車,考試完畢。
參考資料:搜狗百科:科目三考試